Envigado

Durán fez sua estreia profissional pelo Envigado em 13 de fevereiro de 2019 contra o Jaguares de Córdoba na Copa Colômbia,^[3] tendo jogado pelo clube nas categorias de base desde os 11 anos.^[4] Durán marcou seu primeiro gol em 1º de setembro, em sua terceira partida pelo clube, contra o Águilas Doradas Rionegro.^[5] Isso fez de Durán o segundo artilheiro mais jovem da Categoría Primera A, aos 15 anos e 8 meses.^[6]

Em outubro de 2020, Durán foi incluído na lista do The Guardian dos “60 melhores jovens talentos do futebol mundial”.^[7]

Chicago Fire

Em 11 de janeiro de 2021, o Chicago Fire anunciou um acordo para contratar Durán do Envigado em um acordo inicial de três anos, com opções em vigor por mais dois anos. O contrato começaria em 1º de janeiro de 2022.^[8] A taxa de transferência foi relatada em £1,5 milhão. A assinatura foi sancionada pelo diretor técnico do Chicago Fire, Sebastian Pelzer, que viu Durán, de 17 anos, enquanto observava outro jogador em seu antigo clube.^[9]

Durán fez sua estreia no Chicago Fire em 26 de fevereiro de 2022 contra o Inter Miami.^[10] Ele marcou seu primeiro gol pelo clube em 14 de maio de 2022 contra o FC Cincinnati.^[11]

Aston Villa

Em 16 de janeiro de 2023, o clube da Premier League Aston Villa anunciou um acordo para contratar Durán: sujeito a condições médicas, pessoais e um visto de trabalho.^[12] Durán deixou o acampamento colombiano para o Campeonato Sul-Americano de Futebol Sub-20 de 2023 para voar para a Inglaterra para concluir a transferência,^[13] que foi oficializada em 23 de janeiro.^[14] A taxa de transferência foi relatada como sendo de £14,75 milhões iniciais, com o potencial de mais £3 milhões em complementos.^[15]

Em 4 de fevereiro de 2023, Durán fez sua estreia na Premier League como substituto de Leon Bailey na derrota por 4-2 para o Leicester City.^[16]

Em 20 de agosto de 2023, Durán marcou seu primeiro gol no Aston Villa como substituto na vitória por 4-0 contra o Everton.^[17] Em 31 de agosto, Durán marcou seu primeiro gol em uma competição europeia na vitória por 3 a 0 na UEFA Europa Conference League sobre o clube escocês Hibernian.^[18] Em setembro de 2023, Durán marcou um meio-voleio de peito em um jogo da Premier League contra o Crystal Palace, que foi premiado como o Gol da Temporada do Aston Villa na cerimônia de premiação do final da temporada do clube.^[19] Em 13 de maio de 2024, ele marcou sua primeira dobradinha no clube, marcando gols no final do empate por 3 a 3 contra o Liverpool após um déficit de dois gols, mantendo a busca de seu clube por uma vaga na Liga dos Campeões da UEFA.^[20]

Embora tenha sido vinculado a transferências para o West Ham United e o Chelsea, Durán não foi incluído no elenco de pré-temporada do Aston Villa. Ele causou polêmica ao imitar o gesto de "martelos" do West Ham em uma transmissão ao vivo.^[21] No entanto, em 17 de agosto de 2024, Durán marcou o gol da vitória em uma vitória por 2 a 1 sobre o West Ham, tendo começado como substituto, comemorando ao restabelecer seu compromisso com o Villa.^[22] Ele então marcou gols consecutivos da vitória como substituto contra o Leicester City e o Everton, com o último sendo um chute de longa distância amplamente elogiado.^[23]

Em 2 de outubro de 2024, ele marcou seu primeiro gol na Liga dos Campeões da UEFA, garantindo uma vitória por 1 a 0 contra o Bayern de Munique ao chutar de longe para o gol de Manuel Neuer.^[24] Cinco dias depois, Durán assinou um novo contrato com o Aston Villa até 2030.^[25] No mesmo dia, seu gol contra o Everton foi nomeado Gol do Mês da BBC em setembro.^[26] Em 11 de outubro, Jhon Durán foi nomeado jogador do mês do Aston Villa em setembro,^[27] e seu gol contra o Everton também recebeu o prêmio oficial de Gol do Mês da Premier League daquele mês.^[28]

Al-Nassr

Em 29 de janeiro de 2025, Jhon Durán aceitou a proposta do clube árabe Al-Nassr, que desembolsou 77 milhões de euros (cerca de R$473 milhões, conforme a cotação da época) pela transferência aos Villans, além de bônus por metas ao atleta.^[29]

Pela equipe árabe, Jhon se destacou rapidamente. Nos seus dois primeiros jogos na Liga Saudita de Futebol fizera quatro gols, sendo dois dobletes diante o Al-Fayha^[30] e Al-Ahli.^[31] Na terceira partida recebeu um cartão vermelho em duelo contra Al-Ettifaq.^[32]

Ao longo da metade final da temporada ficou marcado por suas boas jogadas. A equipe terminou em 3º na Liga e foi eliminada na semifinal da Copa do Rei. O clube capitaneado por Cristiano Ronaldo lamentou mais uma época sem troféus, porém Durán a terminou com 12 gols em 18 jogos.^[33]